Растительный и животный мир Верхнеяузского водно-болотного комплекса богат и разнообразен!

Здесь произрастают осока, тростник южный, вейник болотный, рогоз, разные виды ив и ольхи. По берегам, на месте выпадающей поросли берёзы, ели и сосны формируются черноольховники. Ольха хорошо выдерживает длительное затопление.

На открытых акваториях (плёсах) произрастают кубышка жёлтая и кувшинка белоснежная, поверхность воды на мелководьях покрыта ряской. Хорошо развиты подводные заросли рдестов, роголистника и других погруженных растений. 

Характерной особенностью Яузских болот является образование сплавин — плотных надводных образований из переплетения корней травянистых растений, кустов и деревьев. Оторванные куски сплавины при высоком уровне воды и сильном ветре свободно перемещаются по акваториям и порой создают заторы в русле Яузы.
Несмотря на городское окружение, в этом уникальном месте обитают дикие звери – американская норка, бобр, ондатра. Нередко посещают его лоси и кабаны. 

Мелководные зарастающие озёра имеют большое значение для водоплавающих и околоводных птиц в периоды гнездования и пролёта. Особенно важны Мытищинские плавни — самый обводнённый отрезок Яузских болот, расположенный в западной части. 

Авифаунистическое разнообразие Верхнеяузских болот довольно высоко. Самый массовый гнездящийся вид - озёрная чайка. Общая численность достигает 10–12 тысяч пар, что может составлять более половины от всей численности вида в Московской области. 

На протяжении года здесь зарегистрировано более 50 видов — гагар и поганок, цапель и выпей, лебедей, гусей и уток, пастушковых птиц и журавлей, куликов, чаек и крачек. Встречаются здесь и хищные птицы — болотный лунь, чёрный коршун, скопа, ястребы — тетеревятник и перепелятник, соколы — чеглок и пустельга. 

Регулярные встречи на территории орлана-белохвоста — одной из самых крупных хищных птиц России (размах крыльев до 2,5 м), может свидетельствовать о благополучном экологическом состоянии водно-болотного комплекса и отсутствии сильного беспокойства со стороны людей.